北交所主体办公、工商注册及官方通讯地址统一设在北京市西城区金融大街丁26号金阳大厦，同时在同片区配套业务办事点，全国多地设有区域服务基地辅助业务落地，核心行政与交易调度中心始终扎根北京金融街核心金融集群。这座金阳大厦同时也是全国中小企业股份转让系统的办公驻地，北交所自设立之初就和新三板股转公司采用一套运营团队合署办公的模式，从注册登记、交易系统运维到监管审核都在这栋楼宇内完成核心运转，所有公文邮寄、信访投诉、监管材料递交、投资者线下沟通的官方收件地址均为此处，邮政编码固定为100033。
金融大街所在的北京西城区金融街是国内金融监管与国家级金融机构聚集区，证监会、多家大型金融机构、行业自律协会均坐落于此，选址在这里能让北交所快速对接顶层监管体系，高效完成上市审核、交易规则修订、市场风控调度等工作，缩短监管沟通和政策落地的流程。不少普通投资者会混淆北交所线下办事点位，除金阳大厦主楼外，面向券商、挂牌企业的线下业务受理窗口设置在金融大街27号投资广场A座，专门处理机构会员业务、挂牌资料初审、线下问询接待等事务，个人投资者咨询、开户疑问、交易申诉依旧以金阳大厦投资者服务部和全国客服热线为主要对接渠道，两处办公点相隔不远，同属金融街步行可达范围。
除北京核心总部外，北交所为覆盖全国中小企业服务需求，在国内多个区域设立了地方服务基地，西南服务基地、华东联络站点、华南协同服务点陆续落地，主要负责地方企业上市辅导宣讲、政企对接、中小企业投融资普及工作，但这些外部站点仅承担市场推广和线下服务职能，不具备交易撮合、上市审批、资金清算、监管执法等核心权限，所有上市审核决议、交易系统运行、违规处罚裁定依旧由北京金融街的总部统一把控。这种总部集权+区域服务网点的布局，既保证资本市场规则执行的统一性，又能下沉服务，对接各地专精特新中小企业的上市融资诉求。
很多交易者会把北交所物理地址和沪深交易所地理位置做对比，上交所扎根上海、深交所落地深圳，三大交易所分驻不同城市形成错位服务格局，北交所立足北京，主打创新型中小企业融资赛道，依托首都金融监管资源完善自身制度建设。对于普通散户而言，无论总部设在哪里，日常交易全程线上完成，无需前往线下地址，只有企业挂牌申报、机构会员报备、正式信访举证等对公业务，才需要按照官方地址邮寄材料或现场办理，日常参与北交所股票交易仅通过券商线上账户操作即可完成全部流程。
