去中心化交易所有手续费，且其手续费由协议交易费与链上Gas费两部分构成，并非完全免费，这是与中心化交易所最核心的费用差异之一。
DEX的协议交易费是交易时直接扣除的固定比例费用，核心用于激励流动性提供者。主流DEX如Uniswap、SushiSwap、PancakeSwap的标准费率普遍为0.3%。UniswapV3已细分多档费率，稳定币对低至0.05%，风险资产最高达1%。SushiSwap的0.3%手续费中，0.25%分给LP，0.05%分配给xSUSHI质押者。Curve专注稳定币兑换，费率仅0.04%，为行业极低水平。部分聚合器类DEX如GateDEX虽宣称0%平台费，但用户仍需支付底层网络与流动性池费用。
链上Gas费是DEX独有的浮动成本，支付给区块链验证者以确认交易，受网络拥堵与合约复杂度影响极大。以太坊主网拥堵时，单笔兑换Gas费可超50美元，小额交易成本占比极高。Layer2网络与新兴公链大幅降低成本，Arbitrum上同等交易Gas费约0.16美元，Solana链上可低至0.0022美元。Gas费计算公式为（基础费+优先费）×实际消耗量，EIP-1559后机制更透明但仍随网络波动。
DEX手续费与CEX存在显著区别。CEX通常将成本整合为单一maker/taker费率，无额外Gas费，常有阶梯优惠。DEX无阶梯减免，费用波动大，总交易成本需叠加协议费与Gas费。大额交易在低Gas时DEX更具优势，小额高频交易在以太坊主网可能因Gas费导致亏损。选择低Gas网络、优化交易时段、选用低费率DEX可有效控制成本。
随着DeFi发展，DEX手续费机制持续演进。UniswapV4将费用拆分为LP费与上限0.1%的协议费，支持动态调整。部分DEX将手续费与代币经济结合，用于回购、分红或生态激励。Layer2普及与公链性能提升正持续压缩Gas成本，让DEX手续费整体更具竞争力。
